Prototype est une bande dessinée 2009 réalisée par DC Wildstorm qui a été lancé avec le jeu. Il est écrit par Justin Gray et Jimmy Palmiotti, et avec l'art de Darick Robertson et Matt Jacobs. Il révèle plus sur Hope, Idaho, Elizabeth Greene et l'épidémie virale. Il y a 6 problèmes de la bande dessinée.