Avec les deux jeux principaux, Radical a collaboré avec deux éditeurs de bande dessinée à publier une série de bandes dessinées détaillant l'arrière-plan pour le jeu.
COMICS SÉRIES[]
[PROTOTYPE][]
- Article principal: Prototype Comics
La première série a été diffusée avec collaboration avec des productions WildStorm. Cette série se composait de six problèmes et l'attention principale était l'histoire du Détective McKlusky et Ella Garcia. Les livres ont également fourni les antécédents de Peter Randall, Robert Cross et Elizabeth Greene.
[PROTOTYPE 2][]
- Article principal: Prototype 2 Comics
La deuxième version est en collaboration avec Dark Horse Comics. Cette série a été divisée en trois problèmes, chacun détaillant différentes histoires et comblant l'écart narratif entre Prototype et Prototype 2.